Alla tre åtalas även för deltagande i terrororganisation, grovt brott, tillsammans med en fjärde man i 60-årsåldern, som greps drygt en månad efter Tyresötillslaget.
Alla fyra ska ha "agerat på uppdrag av IS i Somalia".
De två bröderna, 23 och 25 år gamla, ska ha konverterat till islam en tid före ingripandet och börjat klä sig annorlunda. Den äldre av dem har enligt åtalet tagit emot instruktioner från IS om att "döda så många som möjligt hos de otrogna, med judiska mål som huvudsakligt målval".
Stoppade dåd
Personerna hade olika roller, men alla har en koppling till en islamsk kulturförening i Tyresö, som också beskrivits som en moské, där polisen gjorde sitt tillslag den 7 mars i år.
Den bedömning vi gjorde vid själva ingripandet var att vi behövde agera för att avbryta den här planerade brottsligheten och avvärja ett möjligt attentat, säger Fredrik Hultgren-Friberg, presstalesperson på Säpo.
Det finns även en koppling till ett kriminellt nätverk i Tyresö, bland annat vad gäller vapenförsörjning, enligt åklagare Lars Hedvall som lett utredningen.
De tre männen har enligt Hedvall befattat sig med en pistol som skulle användes för att utföra eller främja brotten. De har även haft ett elchockvapen som skulle användas som hjälpmedel.
"Även om vi inte funnit det vapen som hanteras i förberedelsebrottet anser jag att bevisningen i den delen är stark", säger Hedvall i ett pressmeddelande.
Reste till Turkiet
En del av bevisningen gäller 25-åringen som sommaren 2023 svor trohet till IS.
Mannen ska aktivt ha sökt efter barn som kunde utföra attentat, och av åtalet framstår han som den mest drivande. Han ska även ha haft kontakter med personer som kunde hjälpa till med bombtillverkning, och i februari 2023 försökte han ta sig till Somalia för att ansluta till IS, enligt åtalet. Han stoppades dock i Turkiet.
Av åtalet framgår bland annat att Säkerhetspolisen avlyssnat kulturföreningen.
Där har bröderna bland annat hörts prata om att de letar efter barn som är "beredda att dö som martyrer", att man ska "döda många" och att man "måste se blod", samt att det inte är något problem om barn dödas.
Alla fyra som åtalas nekar till brott. En femte person som också varit häktad i målet släpptes på fri fot i oktober då misstankarna mot honom lades ned.