Guardiola sågade efter segern mot Plymouth i helgen den boll som används i liga- och FA-cupen.
Champions League-bollen är exceptionell, Premier League-bollen är exceptionell men den här är inte bra, sade Guardiola efter 3–1-segern.
Han förklarade att de många avslut som gick över målet berodde på bollen, som är av ett annat märke än de som används i ligan och i Champions League.
Men FA rycker ut till bollens försvar.
Alla fotbollar i det professionella spelet måste uppfylla Fifas kvalitetskrav och den här bollen uppfyller alla testkrav. Vi förstår att det är en subjektiv åsikt vilken boll som är bäst, men vi är trygga i förvissningen om att den här bollen uppträder som den ska, säger en talesperson för förbundet.
Motståndarfansen dröjde inte med att förlöjliga Arteta efter hans uttalanden efter 0–4-förlusten totalt i semifinalerna mot Newcastle.
Det återstår att se hur Guardiolas klagomål tas emot.
Manchester City är klart för kvartsfinal, där Bournemouth väntar.
