Inga större skador har ännu påträffats på den aktuella ön Amorgos, men de runt 2 000 invånarna uppmanas trots det lämna ön – vilket de flesta uppges ha gjort.
Beslutet kommer att ge myndigheter snabbare tillgång till statliga resurser, och kommer sedan ett skalv under tidig onsdag hade magnituden 5,0.
För en knapp vecka sedan utlystes nödläge på närliggande Santorini, vars 16 000 invånare har lämnat sin ö. Där håller skolorna stängt åtminstone den här veckan ut.
Universitet i Aten har sedan den 26 januari uppmätt över 14 000 skalv i havet runt Santorini, en seismisk aktivitet som förbryllat forskarna.
Skalven har hittills orsakat minimal skada.
