Tågstoppet råder sedan en person blivit påkörd av en bil vid en järnvägsövergång mellan Upplands Väsby och Rosersberg vid 8.30-tiden. Det finns ingen prognos för när trafiken kan vara i gång igen.
Även flygplatståget Arlanda Express står still till följd av olyckan, rapporterar flera medier.
SMHI tonade under torsdagsförmiddagen ned en tidigare utfärdad orange varning till en gul över ett område norr om Stockholm till norr om Gävle.
De största (snö)mängderna ser ut att ha kommit över Uppland, där det har kommit uppemot fyra decimeter, säger Lisa Frost, meteorolog på SMHI.
En gul varning är också utfärdad för Västerbottens kustland. Den kan komma att uppgraderas och SMHI föreslår att man håller sig uppdaterad om varningarna på dess hemsida.
Flyg, tåg och bussar inställda
I Gävleborgs län har flera regionaltåg ställts in. Trafikverkets tågkarta visar att flera tåg är försenade på sträckan mellan Uppsala och Gävle. Alla skolbussar i Gävle ställs in under torsdagsmorgonen, enligt lokala medier. En skola i Älvkarleby respektive en i Tierps kommun uppmanar eleverna att hålla sig hemma.
Det är småstökigt överallt. Det är inga jätteskador någonstans. Men det är lite krångligt, kan man väl sammanfatta det med, säger Katarina Wolffram på Trafikverket.
I Uppsala kör trafikbolaget UL med reducerad trafik.
"Inte säkert"
Västerbottens kustland har också drabbats av ymnigt snöfall, enligt SMHI. Det bedöms börja mattas av först på fredag. Träd har fallit över vägar och bilar har åkt i diket.
Det är stökigt, det är riktigt stökigt, säger Daniel Andersson vid räddningstjänsten i Skellefteå och fortsätter:
Behöver man inte ut och åka så ska man inte göra det.
Inga plan har kunnat lyfta från eller landa på flygplatsen i Umeå under torsdagen. Det är främst lokal dimma, i kombination med begränsningar i de så kallade slottiderna på Arlanda, som ställer till det.
Det är ju rejäla förseningar, säger flygplatschefen B-O Lindgren.
Omkring 9 000 hushåll, främst i kustområdet, hade strömavbrott under torsdagsmorgonen, enligt P4 Västerbotten. Det rör sig om kunder till Skelleftekraft och Umeå Energi.
Skelleftekraft har kallat hem reparatörer i vissa områden under tidig torsdagsmorgon, då det blivit för farligt att jobba där.
Det är våra reparatörer som har upplevt att träd har gått omkull inte så långt ifrån dem och att det inte är säkert att jobba på platsen, säger Elin Ala vid Skelleftekraft till TT.
Det finns därför ingen prognos för när alla kan ha strömmen tillbaka.