Anledningen till sanktionerna är att myndigheter i Hongkong inskränker invånarnas fri- och rättigheter, säger Rubio i ett uttalande från det amerikanska utrikesdepartementet.
Polischefen Raymond Siu Chak-yee sätts därmed upp på det amerikanska finansdepartements sanktionslista. Tidigare har sanktioner riktats mot Hongkongs högste ledare, John Lee.
USA konstaterar också att myndighetspersoner aktivt försökt tysta eller skrämma 19 prodemokratiska aktivister som flytt till USA.
Marco Rubio har under sin tid som republikansk senator kritiserat Kina och bristen på mänskliga rättigheter i landet.
