Det är oklart om dekretet riktar sig mot både elit- och breddidrott.
Enligt South Carolina-republikanen Nancy Mace, ledamot i representanthuset, syftar det till att "försvara rättigheterna för kvinnliga idrottare, som har kämpat hela sitt liv för att kunna tävla på högsta nivå".
Endast två kön i USA
Redan under sin första dag som president undertecknade han ett dekret där det slogs fast att den officiella ståndpunkten för USA:s regering är att det endast finns två kön.
Trump rev då även upp Joe Bidens order som tillät transpersoner att tjäna i USA:s armé, samt direktiv ämnade att förebygga diskriminering baserad på könsidentitet och sexuell läggning.
Frågan om könstillhörighet och transpersoners rättigheter i idrotten har varit omdebatterade de senaste åren och en rad idrotter har sett över sina regelverk.
Den amerikanska simmaren Lia Thomas blev 2022 den första transkvinnan som blev collegemästare i USA, men hon tilläts inte tävla internationellt.
Enligt Internationella simförbundets transregler, som infördes just 2022, måste en person som fötts som man ha genomgått en könskorrigering innan tolv års ålder för att få tävla med kvinnor. Lia Thomas påbörjade sin könskorrigering som 20-åring 2019.
Thomas tog saken till idrottens skiljedomstol Cas, men fick inget gehör för sitt överklagande.
"Skydda kvinnors idrott"
Även Internationella friidrottsförbundet har sagt nej till transpersoner i damklasserna. Förbundets ordförande Sebastian Coe kandiderar nu till att bli ny ordförande i IOK (Internationella olympiska kommittén) och britten sade i en intervju i november att kvinnors idrottande måste skyddas.
Om vi inte skyddar kvinnors idrott och inte har klara och otvetydiga riktlinjer för att göra det riskerar vi att förlora damidrotten. Personligen, och som ledare för en olympisk idrott, vill jag inte att det ska hända, sade Coe till AFP.
I somras rasade en debatt kring de kvinnliga boxarna Imane Khelifs och Lin Yu-Tings medverkan i Paris-OS. Internationella boxningsförbundet Iba hävdade att de inte klarat ett könstest 2023, men IOK sade att testet inte var giltigt och gav bägge boxarna grönt ljus i OS.
Båda vann sedan OS-guld.
Jag tror inte att man kan ta lätt på idrotter som boxning. Man behöver ha tydliga regler, som behövs i alla idrotter, sade Coe om den debatten.