"Vi stöttar stolt Premier Leagues regnbågskampanj och står samman med hbtqi-rörelsen för jämlikhet och acceptans", skriver klubben i ett uttalande enligt flera brittiska medier.
"Samtidigt respekterar vi det fattade beslutet av vår lagkapten Sam Morsy, som har valt att inte bära regnbågsbindeln på grund av sin religiösa tro", skriver Ipswich vidare.
Egyptiern Morsy är praktiserande muslim och det var i 0–1-förlusten borta mot Nottingham som han hade på sig en vanlig lagkaptensbindel.
Även tisdagens hemmamatch mot Crystal Palace ingår i Premier Leagues regnbågskampanj.