Kansliet skriver i ett uttalande att den terrorstämplade rörelsen "kräver att man ska få bestämma vilka terrorister som ska släppas". Från israeliskt håll anser man att detta går emot överenskommelsen. Netanyahu har därför instruerat förhandlarna att avvisa kravet.
Uttalandet kommer bara ett par timmar efter det att Netanyahu via sitt kansli meddelat att vissa detaljer kvarstår och att dessa måste klaras ut innan avtalet blir formellt godkänt.
Qatars premiärminister Mohammed bin Abdulrahman bin Al-Thani sade tidigare på onsdagen att parterna träffat en överenskommelse om vapenvila.
Medlarna hade hoppats nå ett avtal i tre faser, men ännu är Israel och terrorstämplade Hamas bara överens om den första, då vapnen ska läggas ned i 42 dagar – från klockan 12 på söndag.