Flera stats- och regeringschefer väntas delta i mötet, de flesta via videolänk, enligt presidentkansliet Élysée i Paris.
Samtalen är en fortsättning på det krismöte som Macron kallade till i måndags, där europeiska ledare deltog tillsammans med EU-kommissionen och Natos ledare.
Sverige representerades av Danmark vid måndagens möte, då den danska statsministern Mette Frederiksen förde talan för nordiska och baltiska länder.
Flera länder uttryckte missnöje över att inte ha fått någon inbjudan till Parismötet i måndags, däribland Rumänien och Tjeckien. Macron har ett bilateralt möte med Rumäniens interimspresident Ilie Bolojan under onsdagseftermiddagen.
Bland länderna som deltar i onsdagens videokonferens finns, förutom Sverige, bland annat Finland, Bulgarien, Kroatien och Tjeckien.
