Ordern kommer efter det att tre tomma bussar i en förort till Tel Aviv exploderat sent på torsdagskvällen. Inga personer fanns ombord eller i närheten av fordonen, men polis på plats upptäckte ytterligare två bomber. De kunde enligt polisen desarmeras.
"Premiärministern har beordrat IDF (militären) att genomföra en intensiv operation mot terrornästen", uppger Netanyahus kansli på X.
Polis och säkerhetspolis har också beordrats att öka ansträngningarna för att förebygga ytterligare attacker i israeliska städer.
Israels försvarsminister Israel Katz anklagar "palestinska terrorister" för explosionerna, i ett uttalande på torsdagskvällen.
