Motionen skulle ha behövt 289 röster för att antas av en majoritet av den 577 platser stora nationalförsamlingen. Men bara 197 ledamöter anslöt sig till misstroendet mot Barnier.
Michel Barnier kommer från den traditionella högern och har bland annat förhandlat om Storbritanniens utträde ur EU. Han utsågs nyligen av president Emmanuel Macron i ett försök att skapa stabilitet efter det svåra parlamentariska läget efter valet i juli.
Den 73-årige premiärministern har sedan dess flaggat för att Frankrike står inför en finansiell kris om budgetunderskottet inte minskar och varnat för skattehöjningar för höginkomsttagare.
Macron själv har under de senaste veckorna märkbart tagit ett steg tillbaka, särskilt i inrikesfrågor, samtidigt som han knappt uttalat sig offentligt.
