Svensken slutade femma i heatet och därmed fanns det ingen möjlighet att gå vidare ens på tid för Anger.
Världscupledaren Johannes Høsflot Klæbo vann semifinalen före landsmannen Erik Valnes. Anger slutade femma och var 57 hundradelar bakom fyran Jules Chappaz, Frankrike, som tillsammans med trean Oskar Opstad Vike gick vidare på tid.
Angers tid i semifinalen var över två sekunder snabbare än norrmannen Even Northugs vinnartid i den andra semifinalen.
Det var inte vad jag ville med dagen. Jag går för det och tänker att det ska bli ett snabbt och bra heat men får inte alls farten med mig och de kommer med bättre fart bakom. Segt, säger Anger.
Det är bara att ladda om och komma tillbaka revanschsugen i morgon, men det är surt, fortsätter han.
Anger var ensam svensk i semifinal. De uttagna VM-åkarna Marcus Grate och Oskar Svensson blev utslagna redan i kvalet.
Det finns inget värre i den här sporten att åka ut i kvalet när man vet att man är kapabel att vara på pallen. Det är något som inte stämmer med prologen i år för mig, säger Grate, färsk SM-vinnare och världscuptrea i den sista sprinttävlingen på Tour de Ski, till Viaplay.
Edvin Anger hade tredje snabbast tid i kvalet och vann sedan sin kvartsfinal innan dagen tog slut i semifinal.
Klæbo vann finalen före de båda landsmännen Valnes och Opstad Vike.
